Akárcsak tehát a szezonnyitó viadalon, Katarban, úgy Estorilban is Sandro Cortese kaparintotta meg a pole pozíciót a legkisebb géposztályban. Az igen rutinosnak mondható német versenyző több alkalommal is áll az élen az edzés során, azonban a Red Bull KTM pilótájának egyáltalán nem volt könnyű dolga a tréning során. Az első tíz percben például Vinales és Oliveira állt az élen, akiket kezdetben Antonelli és Vazquez követett. Az edzés feléhez érkezve azonban eljött Cortese ideje, aki egy nagyszerű körrel az élre áll és jó ideig tartani is tudta pozícióját. Ekkor egyébként a következőképpen nézett ki a top10 sorrendje: Cortese, Oliveira, Salom, Vasquez, Faubel, Fenati, Binder, Vinales, Kornfeil és Antonelli. Visszatérve azonban az időmérő első felére: Mindenképpen meg kell jegyezni, hogy volt pár perc, amely kimondottan az Aspar csapatban szereplő Hector Faubelről szólt, aki Miguel Oliveira szélárnyékát kihasználva 2-3 jobb kört meg tudott tenni. Akkor még úgy tűnt, hogy talán a 2007-es világbajnoki ezüstérmesnek (125 ccm) akár a rajtelsőség megszerzésére is lehet esélye, azonban végül is be kellett érnie egy kilencedik hellyel. A véghajrában természetesen Vinales és Olveira is a pole-ért ment, azonban sem a spanyol, sem a portugál nem tudott harcba szállni Cortese nagyszerű idejével. A leintést követően egyedül Khairuddin ment egy igen figyelemre méltó időt, aminek köszönhetően a maláj motoros az ötödik rajthelyet szerzete meg. A világbajnoki pontversenyt vezető Romano Fenati a hatodik helyről vághat majd neki a holnapi viadalnak.